Trả lời ngắn: Từ 01/01/2026, điều kiện hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) được nới lỏng quan trọng: khoản 3 Điều 1 Luật 149/2025/QH15 đã bãi bỏ điều kiện “người bán đã kê khai, nộp thuế” — tức bãi bỏ điểm c khoản 9 Điều 15 của Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15. Từ thời điểm này, hồ sơ hoàn thuế chỉ còn áp dụng 2 điều kiện theo văn bản hợp nhất mới nhất của Luật Thuế GTGT. Song song, Công văn 6936/CT-QLTT (ngày 18/9/2026) hướng dẫn cơ quan thuế không được giữ toàn bộ tiền hoàn chỉ vì một phần hồ sơ có rủi ro — chỉ không hoàn hoặc thu hồi khi có đủ căn cứ qua kiểm tra, xác minh. Bài viết chỉ đề cập điều kiện và thủ tục mới năm 2026, không viết về cơ chế lựa chọn của doanh nghiệp xuất khẩu.
1. Bãi bỏ điều kiện “người bán đã kê khai, nộp thuế”: Luật 149/2025/QH15
Trước đây, một trong những “nút thắt” lớn nhất của hoàn thuế GTGT là điều kiện tại điểm c khoản 9 Điều 15 Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15: người bán hàng hóa, dịch vụ phải đã kê khai, nộp thuế thì người mua mới được hoàn thuế đầu vào. Trên thực tế, người mua không thể kiểm soát việc người bán có kê khai, nộp thuế hay không — dẫn đến nhiều hồ sơ hoàn thuế bị ách tắc vì lỗi của bên bán.
Khoản 3 Điều 1 Luật 149/2025/QH15 (hiệu lực 01/01/2026) đã bãi bỏ điều kiện này. Hệ quả:
- Từ 01/01/2026, điều kiện hoàn thuế GTGT chỉ còn 2 điều kiện — người nộp thuế đối chiếu văn bản hợp nhất mới nhất của Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15 (văn bản đã qua nhiều lần sửa đổi, bổ sung) để xác định đầy đủ;
- Doanh nghiệp mua hàng không còn bị “treo” tiền hoàn vì người bán chưa kê khai, nộp thuế — rủi ro này được tách khỏi nghĩa vụ của người mua;
- Cơ quan thuế không được viện dẫn điều kiện đã bị bãi bỏ để từ chối hoàn thuế cho các kỳ phát sinh từ 01/01/2026.
2. Công văn 6936/CT-QLTT: không giữ toàn bộ tiền hoàn vì một phần rủi ro
Công văn 6936/CT-QLTT (ban hành 18/9/2026) đưa ra hướng dẫn xử lý rủi ro trong hoàn thuế GTGT với nguyên tắc bảo vệ người nộp thuế tuân thủ:
- Cơ quan thuế không được giữ lại toàn bộ số tiền hoàn chỉ vì một phần của hồ sơ được đánh giá có rủi ro;
- Việc không hoàn thuế hoặc thu hồi tiền hoàn chỉ được thực hiện khi có đủ căn cứ trên cơ sở kiểm tra, xác minh cụ thể — không dựa trên nghi ngờ chung chung;
- Phần hồ sơ không có rủi ro phải được giải quyết hoàn thuế bình thường, đúng thời hạn.
Đây là thay đổi có ý nghĩa thực tiễn lớn: trước đây, chỉ cần một hóa đơn trong chuỗi bị đặt dấu hỏi, toàn bộ hồ sơ hoàn thuế của doanh nghiệp có thể bị “đóng băng” nhiều tháng. Từ hướng dẫn này, cơ quan thuế phải tách bạch xử lý — phần rủi ro thì kiểm tra, xác minh; phần còn lại thì hoàn đúng hạn.
3. Doanh nghiệp cần làm gì với hồ sơ hoàn thuế 2026
- Rà soát lại các hồ sơ bị từ chối/treo vì lý do “người bán chưa kê khai, nộp thuế” cho các kỳ từ 01/01/2026 — căn cứ bãi bỏ tại khoản 3 Điều 1 Luật 149/2025/QH15 để đề nghị xem xét lại;
- Đối chiếu văn bản hợp nhất mới nhất của Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15 để xác định đầy đủ 2 điều kiện hoàn thuế còn lại áp dụng cho trường hợp của mình;
- Khi cơ quan thuế giữ lại tiền hoàn: yêu cầu văn bản nêu rõ căn cứ kiểm tra, xác minh theo tinh thần Công văn 6936/CT-QLTT — không chấp nhận việc giữ toàn bộ tiền hoàn chỉ vì một phần rủi ro mà không có căn cứ cụ thể;
- Chuẩn bị hồ sơ chứng minh tính hợp lệ của hóa đơn, chứng từ đầu vào thuộc phần không có rủi ro để được hoàn đúng hạn.
Câu hỏi thường gặp
Điều kiện “người bán đã kê khai, nộp thuế” còn áp dụng khi hoàn thuế GTGT không?
Không còn, đối với các kỳ từ 01/01/2026. Khoản 3 Điều 1 Luật 149/2025/QH15 đã bãi bỏ điều kiện này (điểm c khoản 9 Điều 15 Luật Thuế GTGT 48/2024/QH15).
Từ 01/01/2026 hoàn thuế GTGT còn mấy điều kiện?
Còn 2 điều kiện — đối chiếu văn bản hợp nhất mới nhất của Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15 để xác định đầy đủ.
Cơ quan thuế có được giữ toàn bộ tiền hoàn vì một hóa đơn có rủi ro không?
Không. Theo Công văn 6936/CT-QLTT (18/9/2026), cơ quan thuế không được giữ toàn bộ tiền hoàn chỉ vì một phần hồ sơ có rủi ro; chỉ không hoàn/thu hồi khi có đủ căn cứ kiểm tra, xác minh.
Hồ sơ hoàn thuế bị treo trước đây vì lỗi người bán có được xem xét lại không?
Với các kỳ phát sinh từ 01/01/2026, doanh nghiệp có căn cứ (khoản 3 Điều 1 Luật 149/2025/QH15) để đề nghị cơ quan thuế xem xét lại các hồ sơ bị từ chối hoặc treo vì điều kiện đã bị bãi bỏ.
Bài viết này có đề cập cơ chế hoàn thuế của doanh nghiệp xuất khẩu không?
Không. Bài viết chỉ tập trung điều kiện và thủ tục hoàn thuế GTGT mới năm 2026.
Văn bản trích dẫn
- Luật 149/2025/QH15 — khoản 3 Điều 1 (hiệu lực 01/01/2026): bãi bỏ điều kiện “người bán đã kê khai, nộp thuế” (điểm c khoản 9 Điều 15 Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15); từ 01/01/2026 còn 2 điều kiện hoàn thuế;
- Công văn 6936/CT-QLTT (18/9/2026): không giữ toàn bộ tiền hoàn vì một phần rủi ro; chỉ không hoàn/thu hồi khi có đủ căn cứ kiểm tra, xác minh;
- Đối chiếu văn bản hợp nhất mới nhất của Luật Thuế giá trị gia tăng 48/2024/QH15 (văn bản đã qua nhiều lần sửa đổi, bổ sung) khi áp dụng.
Doanh nghiệp đang chuẩn bị hồ sơ hoàn thuế GTGT và cần rà soát điều kiện theo quy định mới 2026 — từ tính hợp lệ của hóa đơn đầu vào đến xử lý khi cơ quan thuế đặt vấn đề rủi ro? Liên hệ qua trang Liên hệ của FLAT Law Firm để được tư vấn hoàn thuế đúng quy định.
Nội dung pháp lý của bài viết do FLAW AI Legal Council soát xét và trình chủ sở hữu phê duyệt; đây không phải ý kiến của luật sư người thật và không thay thế tư vấn pháp lý cho từng trường hợp cụ thể.
Thông tin tham khảo, không phải tư vấn pháp lý.
