Điểm thuế quan trọng nhất của ngành y tế: dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT — nhưng ranh giới giữa “chữa bệnh” và “làm đẹp” là nơi tranh chấp thuế nảy sinh nhiều nhất.
Dịch vụ y tế nào không chịu thuế GTGT
Theo Luật Thuế giá trị gia tăng 2024 (48/2024/QH15, hiệu lực 01/7/2025), dịch vụ khám bệnh, chữa bệnh, phòng bệnh — bao gồm khám, xét nghiệm, chẩn đoán hình ảnh, phẫu thuật điều trị, vận chuyển người bệnh cấp cứu — thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT. Hệ quả thực tế: cơ sở y tế không phải kê khai, nộp thuế GTGT đầu ra cho các dịch vụ này, nhưng đồng thời không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ phục vụ hoạt động không chịu thuế — chi phí thuế đầu vào trở thành chi phí của cơ sở.
Dịch vụ thẩm mỹ: chịu thuế GTGT
Phẫu thuật thẩm mỹ, làm đẹp không vì mục đích chữa bệnh không thuộc diện dịch vụ khám chữa bệnh — phải kê khai, nộp thuế GTGT như dịch vụ thông thường. Cơ sở vừa khám chữa bệnh vừa làm thẩm mỹ phải hạch toán riêng doanh thu và thuế GTGT đầu vào tương ứng; không tách được thì bị ấn định và truy thu phần chênh lệch.
Ưu đãi thuế TNDN cho y tế
Cơ sở y tế thuộc lĩnh vực xã hội hóa (giáo dục, y tế, văn hóa, thể thao, môi trường) được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp — thuế suất ưu đãi và thời gian miễn, giảm theo Luật Thuế TNDN 2025 (67/2025/QH15) và văn bản hướng dẫn, với điều kiện đáp ứng tiêu chí về loại hình, địa bàn và quy mô. Lưu ý: ưu đãi gắn với điều kiện cam kết — không đáp ứng thì bị thu hồi và truy thu (xem thêm chủ đề về thu hồi ưu đãi thuế).
Câu hỏi thường gặp
Bán thuốc trong bệnh viện có chịu thuế GTGT?
Thuốc chữa bệnh thuộc đối tượng chịu thuế GTGT với thuế suất ưu đãi theo biểu thuế (không thuộc diện không chịu thuế như dịch vụ khám chữa bệnh). Bệnh viện bán thuốc phải kê khai thuế GTGT đầu ra và được khấu trừ đầu vào tương ứng.
Phòng khám chỉ làm thẩm mỹ có được hưởng ưu đãi thuế TNDN y tế?
Không, nếu hoạt động thuần túy thẩm mỹ, làm đẹp không vì mục đích chữa bệnh — không thuộc lĩnh vực xã hội hóa y tế được ưu đãi. Cơ sở phải chứng minh hoạt động khám chữa bệnh thực chất.
Không tách được doanh thu khám bệnh và thẩm mỹ thì sao?
Cơ quan thuế có quyền ấn định thuế đối với phần không tách được. Thực tế thanh tra, đây là điểm bị truy thu phổ biến ở các cơ sở y tế đa dịch vụ.
Bài viết đã được FLAW AI Legal Council kiểm tra chất lượng